J. A.  Rafael, ?Pipunculidae (Diptera) da região Neotropical.  II.  Redescrição e retificação da posição genérica de Pipunculus flavicornis Williston e P. xanthopodus Williston colocadas no gênero Allomethus Hardy. [Pipunculidae (Diptera) from the Neotropical region. II.?, Revista Brasileira de Entomologia, vol. 29, pp. 549-553, 1985.

J. A.  Rafael, ?Parapipunculus, a new genus of Pipunculidae (Diptera) from the Nearctic Region and Mexico?, Revista Brasileira de Entomologia, vol. 30, pp. 421-424, 1986.

J. A.  Rafael, ?Amazunculus, a new genus of pipunculid from the Amazon basin (Diptera, Pipunculidae)?, Amazoniana, vol. 10, pp. 15-19, 1986.

J. A.  Rafael, ?Two new genera of Pipunculidae (Diptera) from the New World:  Metadorylas, Gen. N. and Elmohardyia Gen. N., with new synonyms, designation of lectotypes and revalidation of a species?, Revista Brasileira de Entomologia, vol. 31, pp. 35-39, 1987.

J. A.  Rafael, ?Basileunculus, um gênero novo de Pipunculidae (Diptera) da região Neotropical, com chave para as espécies?, Acta Amazonica, vol. 16-17, pp. 627-634, 1987.

J. A.  Rafael, ?Pipunculidae (Diptera) Neotropicais do gênero Elmohardyia Rafael?, Acta Amazonica, vol. 18, pp. 223-264, 1988.

J. A.  Rafael, ?Pipunculidae (Diptera) da região Neotropical.  I. Redescrição de Chalarus chilensis Collin, comb. n. e descrição de duas espécies novas da Amazônia?, Revista Brasileira de Zoologia, vol. 5, pp. 1-9, 1988.

J. A.  Rafael, ?Considerações sobre a filogenia de Nephrocerinae e descrição do macho de Protonephrocerus chiloensis Collin, 1931 (Diptera, Pipunculidae)?, Revista Brasileira de Entomologia, vol. 32, pp. 465-470, 1988.

J. A.  Rafael, ?Descrição de duas espécies novas de Eudorylas Aczél (Diptera: Pipunculidae) de floresta inundável e de terra firme nas proximidades de Manaus, Amazonas, Brasil?, Amazoniana, vol. 10, pp. 401-405, 1989.

J. A.  Rafael, ?Revisão das espécies Neotropicais do gênero Chalarus Walker, 1834 (Diptera: Pipunculidae)?, Iheringia, série Zoologia, vol. 70, pp. 45-53, 1990.

J. A.  Rafael, ?O gênero Allomethus Hardy (Diptera, Pipunculidae)?, Revista Brasileira de Entomologia, vol. 34, pp. 811-815, 1990.

J. A.  Rafael, ?As espécies Neotropicais de Metadorylas Rafael (Diptera: Pipunculidae)?, Boletim do Museu Paraense Emilio Goeldi, Séries Zoologia, vol. 6, pp. 127-164, 1990.

J. A.  Rafael, ?Revisão das espécies Neotropicais do gênero Cephalops Fallén (Diptera: Pipunculidae)?, Acta Amazonica, vol. 20, pp. 353-390, 1990.

J. A.  Rafael, ?As espécies Neotropicais do gênero Pipunculus (S. Str.) Latreille (Diptera, Pipunculidae)?, Revista Brasileira de Entomologia, vol. 35, pp. 179-186, 1991.

J. A.  Rafael, ?Espécies de Eudorylas Aczél do Peru (Diptera: Pipunculidae)?, Boletim do Museu Paraense Emilio Goeldi, Séries Zoologia, vol. 7, pp. 151-161, 1991.

J. A.  Rafael, ?Pipunculidae (Insecta, Diptera) of the Dominican Republic: new records and description of new species?, Annals of the Carnegie Museum, vol. 65, pp. 363-381, 1996.

J. A.  Rafael and De Meyer, M., ?Generic classification of the family Pipunculidae (Diptera): a cladistic analysis?, Journal of Natural History, vol. 26, pp. 637-658, 1992.

J. A.  Rafael and Menezes, M. D.  da S., ?Taxonomic review of Costa Rican Pipunculidae (Insecta: Diptera)?, Revista de biologia tropical, vol. 47, pp. 513-534, 1999.

J. A.  Rafael and Rosa, M. S. S., ?Pipunculidae (Diptera) da Estação Ecológica de Maracá e da localidade de Pacaraima, Roraima, Brasil?, Acta Amazonica, vol. 21, pp. 337-350, 1991.

E. G.  Virla and Rafael, J. A., ?Datos bionómicos preliminares y descripcion de la hembra de Cephalops penepauculus (Hardy) (Diptera: Pipunculidae) um parasitoide de Delphacidae (Homoptera: Auchenorryncha) em Argentina?, Revista de Investigación Centro de Investigaciones para la Regulacion de Poblaciones de Organismos Nocivos, Tucumán, vol. 10, pp. 33-36, 1996.